肛瘘的病因主要是肛门腺感染、化脓，形成肛周脓肿，自然破溃。或经手术切开排脓后，脓肿壁由结缔组织和肉芽组织增生、缩窄成管状，外口缩小，内口继续感染，不能自愈，即成肛瘘。脓肿破溃或切开引流后，常不能治愈。

 

　　肛瘘的具体病因如下：

 

　　1、内口的存在，脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源，肛窦炎或肛腺感染仍可继续存在，肠腔内容物也可从内口继续进入瘘管。

 

　　2、肛门部不能静养，脓腔不易粘合，排粪、排尿时，因括约肌收缩或因炎症刺激肛门括约肌，使肛门括约肌经常处于痉挛状态。

 

　　3、肠腔中的粪便、肠液和气体继续进入瘘管，刺激管壁，使管壁结缔组织增生变厚，管腔难以闭合。

 

　　4、脓腔引流不畅，或外口缩小，时闭时溃，脓液蓄积腔内，导致脓肿再发，并穿破而形成新的支管或窦道。

 

　　5、管道多在不同高度穿插过肛门括约肌，括约肌收缩阻碍脓液排出，以致引流不畅。除此之外，结核、克隆氏病、溃疡性结肠炎、肛管或者肠癌和腹股沟淋巴肉芽肿等，也是形成肛瘘的病因。